門司税関は、明治２２年（１８８９年）に門司港が石炭、米、麦、麦粉、硫黄の特別輸出港に指定されたことに伴い、長崎税関の出張所として設けられ、その後、税関支署に発展し、明治４２年（１９０９年）１１月、長崎税関から分離独立し、我が国７番目の税関として発足しました。

　 税関は、昭和１８年（１９４３年）、第２次世界大戦により一時閉鎖されましたが、昭和２１年（１９４６年）６月、門司税関は、九州全県と山口県を管轄する税関として再開されました。

　 昭和２８年（１９５３年）、長崎税関を分離し現在の姿になり、今、門司税関はアジア太平洋地域との人と物の玄関口として大きく躍進しています。

　　→　門司税関庁舎の歴史

　 平成２１年（２００９年）、門司税関は長崎税関から分離独立して１００周年を迎え、これまで以上に税関を広く国民の皆様に知ってもらい、税関業務への理解と協力を得ることを目的に100周年記念誌を作成しました。

　　→　門司税関１００周年記念誌は、こちらの「門司港と門司税関の軌跡」に掲載しております。