組織と主要事務
| 部名 | 課名 | 主な事務 |
|---|---|---|
| 総務部 | 総務課 | 税関の所掌事務の総合調整 |
| 人事課 | 職員の任用、服務、人事及び給与 職員の福利厚生 |
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| 会計課 | 会計、行政財産及び物品の管理 | |
| 企画調整官 | 港湾事情等に関する調査 | |
| システム企画調整官 | 電子情報処理組織に関する情報に関する事務 | |
| 税関広報広聴官 | 税関についての広報及び広聴 | |
| 税関考査官 | 税関の所掌事務の運営に関する考査 | |
| 税関監察官 | 税関所属職員の服務に関する監察 | |
| 監視部 | 管理課 | 監視部の運営に関する総合調整 |
| 密輸対策企画室 | 監視取締りの実施及び機器の導入に関する企画・立案 | |
| 統括監視官（取締） | 船舶、航空機の監視取締り、旅客・乗組員の携帯品等の取締り、検査及び徴税 | |
| 統括監視官（検査） | 輸出入貨物等に関する検査 | |
| 特別監視官 | 監視取締りに関して特に処理困難なもの | |
| 保税地域監督官 | 保税地域等の許可又は承認 | |
| 密輸対策管理官 | 密輸対策企画室の事務 | |
| 業務部 | 管理課 | 業務部の運営に関する総合調整 関税、内国消費税等の納付又は徴収事務 |
| 統括審査官（総括） |
輸出入貨物に係る事務の総合調整 |
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| 統括審査官（通関） |
輸出入貨物等に関する申告書等の受理及び審査に関すること |
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| 特別審査官（輸入） | 輸入申告に関して特に処理困難なもの | |
| 特別審査官（輸出） | 輸出申告に関して特に処理困難なもの | |
| 通関業監督官 | 通関業者の監督及び通関士に関する事務 | |
| 税関相談官 | 税関の所掌事務に係る相談及び苦情に関する事務 | |
| 関税鑑査官 | 輸入貨物に係る関税率表の統一的な解釈及び摘要に関すること | |
| 原産地調査官 | 原産地認定の統一的な解釈及び適用に関すること | |
| 認定事業者管理官 | 特定保税承認者及び特定保税運送者の承認に関すること | |
| 知的財産調査官 | 知的財産に関する事務 | |
| 関税評価官 | 関税評価に関する事務 | |
| 調査部 | 管理課 | 調査部の運営に関する総合調整 |
| 調査統計課 | 外国貿易統計の作成 | |
| 統括調査官 | 輸入貨物の価格の調査、輸出入された貨物の調査 | |
| 特別関税調査官 | 輸入貨物の調査に関して特に処理困難なもの | |
| 統括審理官 | 犯則事件の調査及び処分 | |
| 特別審理官 | 特に重大な犯則事件に係るもの | |
| 情報管理官（犯則情報） | 犯則事件に関する情報の管理及び分析 | |
| 情報管理官（通関情報） | 輸出入貨物、船舶、航空機及び旅客の取締りに関する情報に関する事務 |