所在地：長崎市出島町１−３６
　　　　電停「出島」より徒歩２分

長崎港の関所「長崎税関」の現在の庁舎は出島地区にあり、昭和44年に竣工されました。
庁舎屋上の国旗とともに掲げてある、青と白地に赤丸の税関旗が目印です。
長崎税関1階ロビー奥には、税関資料展示室があり、長崎税関に関する史料や長崎港の主要輸出入品、覚せい剤やけん銃などの密輸手口、コピー商品等が展示されています。